Nextstrain build for novel coronavirus SARS-CoV-2

最新的Nextstrain nCoV中文情况报告

此系统发生显示新的冠状病毒(nCoV)COVID-19流行病毒的进化关系。 所有样品相对于一个共同祖先与最多八个突变高度相关,表明在2019年11月至12月某个时间共有一个共同祖先。这表明2019年11月至12月初次人类感染,随后持续的人对人传播导致 采样感染。

站点编号和基因组结构使用Wuhan-Hu-1/2019 作为参考。 系统发育植根于武汉的早期样品。 时间分辨率假定每个位点每年的核苷酸取代率为5 × 10-4个。有关生物信息处理的完整详细信息

SARS相关β-冠状病毒中nCoV的系统发生背景

我们非常感谢作者,他们通过本研究所基于的GISAID提供了遗传序列和元数据的实验室,并为此提交了实验室。 以下是所有原始实验室和提交实验室的完整列表。 通过单击页面底部的“下载数据”,然后在出现的对话框中单击“应变元数据”,可以使用归因表。